أنشئت الأمانة العامة عام 1954م مع قيام أول حكومة وطنية ، وكانت تعرف بسكرتارية مجلس الوزراء .و توسعت اختصاصات الأمانة خلال عقد السبعينات والنصف الأول من الثمانينات لتتماشي مع التوسع الذي تم في الجهاز التنفيذي.